RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 DHDHQ9UQ10 334 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PINLYPA6NC86 204 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 A6NIZ1 184 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PRR32B1ATL7 298 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PSMD9O00233 223 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 GOSR2O14653 212 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ARPC5O15511 151 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 EFSO43281 561 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 AKR7A3O95154 331 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 OR6A2O95222 327 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 WNT11O96014 354 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 MAS1P04201 325 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ITGB2P05107 769 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 F13BP05160 661 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 NMBP08949 121 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF35P13682 527 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF17P17021 662 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RAB6AP20340 208 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 CRABP1P29762 137 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SRD5A2P31213 254 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 DNASE1L1P49184 302 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RAP1BP61224 184 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RAP1AP62834 184 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF345Q14585 488 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SLC17A1Q14916 467 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 C4orf46Q504U0 113 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SMUG1Q53HV7 270 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 WDR38Q5JTN6 314 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TEX30Q5JUR7 227 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SPINK14Q6IE38 97 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 LIN54Q6MZP7 749 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 MDS2Q8NDY4 140 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF519Q8TB69 540 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 GPX8Q8TED1 209 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 HAS2Q92819 552 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC120Q96HB5 630 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ARL6Q9H0F7 186 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 LRFN1Q9P244 771 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PTPRBP23467 1997 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 CIB4A0PJX0 185 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM82A0PJX8 343 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS37A4D1T9 235 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 A8MXK9 166 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 DISC1C4P0D8 188 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 G3V3Y1 287 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 OR2F2O95006 317 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RAB3DO95716 219 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 CYB5AP00167 134 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 MGMTP16455 207 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TBPP20226 339 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ACHEP22303 614 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 MPZP25189 248 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ITGA3P26006 1051 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 KIR3DL2P43630 455 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RRADP55042 308 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RAC1P63000 192 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 H3F3AP84243 136 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 MYBPHQ13203 477 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 OR2F1Q13607 317 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 FAM166AQ6J272 317 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.51□□□□□ -1.05
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