RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469534.1

ITGA6-208, Transcript of integrin subunit alpha 6, human

TSL 2

Gene ITGA6, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA6-208	ENST00000469534	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	GHSR	Q92847	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ATF6B	Q99941	703 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534		R4GMQ9	66 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	LAMA5	O15230	3695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534		A8MXE2	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534		H3BMQ9	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534		M0R135	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OGG1	O15527	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	SULT1C4	O75897	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ZFPL1	O95159	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	UBL3	O95164	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	CDRT1	O95170	752 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	BPNT1	O95861	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	NGF	P01138	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	TTR	P02766	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	INHBB	P09529	407 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	TACSTD2	P09758	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	RNF224	P0DH78	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	COX5A	P20674	150 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	STOM	P27105	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	HOXC12	P31275	282 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OPRM1	P35372	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	APLNR	P35414	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	CRYBB2	P43320	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	PCBD1	P61457	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	PLP2	Q04941	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	PCK2	Q16822	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	WBP1	Q96G27	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	MNT	Q99583	582 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ITGA6-208	ENST00000469534	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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