RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456173.6

NEDD4L-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-208	ENST00000456173	MLC1	Q15049	377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ATP5S	Q99766	215 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	OR51B6	Q9H340	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	TREM2	Q9NZC2	230 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	THBS3	P49746	956 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ZNF85	Q03923	595 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	FUT9	Q9Y231	359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	IDS	B3KWA1	339 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	TIMP2	P16035	220 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	TBP	P20226	339 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	GAL	P22466	123 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SLC6A12	P48065	614 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CSNK1A1	P48729	337 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173		H3BQ15	152 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	BMPR1B	O00238	502 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SLC17A2	O00624	439 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	IGHG1	P01857	330 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	TRGC2	P03986	189 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	OPN1MW	P04001	364 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SLC25A4	P12235	298 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62	2e-6	■□□□□ 9
NEDD4L-208	ENST00000456173	MCHR2	Q969V1	340 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	MPTX1	A8MV57	137 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	PPM1D	O15297	605 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	GLRA1	P23415	457 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	IL2RG	P31785	369 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	AMT	P48728	403 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CAPNS2	Q96L46	248 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173		A8MVM7	634 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	TMPRSS11D	O60235	418 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CTAG2	O75638	210 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	OR2J2	O76002	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ZFPL1	O95159	310 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	C10orf111	Q8N326	155 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	FAM122A	Q96E09	287 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CRH	P06850	196 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	FGF2	P09038	288 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	FBP1	P09467	338 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	GAMT	Q14353	236 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	LTC4S	Q16873	150 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	RAB7B	Q96AH8	199 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	CHST6	Q9GZX3	395 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ADAM11	O75078	769 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SEMA7A	O75326	666 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	ACTL6B	O94805	426 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	WNT11	O96014	354 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SDF2	Q99470	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-208	ENST00000456173	HP	P00738	406 aa		11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms