RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 TPBGQ13641 420 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MAPK11Q15759 364 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DUSP7Q16829 419 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR4C11Q6IEV9 310 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ACSM5Q6NUN0 579 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 AHSA2Q719I0 299 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC43A2Q8N370 569 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR2L5Q8NG80 312 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TXNDC15Q96J42 360 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MGLLQ99685 303 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR51B5Q9H339 312 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LYRM4Q9HD34 91 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MS4A12Q9NXJ0 267 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TREM2Q9NZC2 230 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM129A0AVI4 362 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR2M5A3KFT3 312 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HTR3EA5X5Y0 456 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR5H1A6NKK0 313 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C4orf51C9J302 202 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CLDN34H7C241 214 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HMGN4O00479 90 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FGF17O60258 216 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DIRAS1O95057 198 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MPZL1O95297 269 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 AIFM1O95831 613 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IL1AP01583 271 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LCKP06239 509 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ADORA3P0DMS8 318 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IFNA8P32881 189 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MTNR1AP48039 350 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CRISP3P54108 245 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DEFA1P59665 94 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DEFA3P59666 94 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 VBP1P61758 197 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IFITM3Q01628 133 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IL1RL1Q01638 556 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SPIBQ01892 262 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 EGR4Q05215 589 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RAB40BQ12829 278 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RNF175Q8N4F7 328 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR52N5Q8NH56 324 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CLDND2Q8NHS1 167 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NDNFQ8TB73 568 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MAL2Q969L2 176 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35B4Q969S0 331 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OMA1Q96E52 524 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 KCNS3Q9BQ31 491 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MND1Q9BWT6 205 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PRRG3Q9BZD7 231 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DAPK2Q9UIK4 370 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CES1P1Q9UKY3 287 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 A4GNTQ9UNA3 340 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ASB4Q9Y574 426 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 J3QRK9 145 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEB3O15480 346 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CXCL13O43927 109 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FMO6PO60774 539 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 REM1O75628 298 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NGFP01138 241 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C1QCP02747 245 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SELEP16581 610 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms