RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 TFAP2AP05549 437 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF3P17036 446 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SLC2A5P22732 501 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PAX7P23759 505 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 DCKP27707 260 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 BLVRAP53004 296 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 HIST1H3AP68431 136 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 MVKQ03426 396 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PSG7Q13046 419 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 CPOQ8IVL8 374 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SNX33Q8WV41 574 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 AMELYQ99218 206 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 STARD10Q9Y365 291 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PTGES3LE9PB15 166 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 RGS10O43665 173 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 XPNPEP2O43895 674 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 CRLF1O75462 422 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-13P01766 116 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 CDK1P06493 297 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 HTR1AP08908 422 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SPARCP09486 303 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM18P0DKX4 95 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SLC2A1P11166 492 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 BMP4P12644 408 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SPI1P17947 270 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 GIFP27352 417 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 FMO3P31513 532 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 MTNR1AP48039 350 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 ALDH3B2P48448 385 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 EVX1P49640 407 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF81P51508 661 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 DSCR9P59020 149 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 ST3GAL4Q11206 333 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 POU4F2Q12837 409 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 IRF3Q14653 427 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 KCNMB1Q16558 191 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 NAA40Q86UY6 237 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SPARTQ8N0X7 666 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF511Q8NB15 262 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM80Q96HE8 168 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 COPS4Q9BT78 406 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 MARCH7Q9H992 704 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.68□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 A6NHS1 94 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PRR32B1ATL7 298 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 H0YL77 283 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFS8O00217 210 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 MLNRO43193 412 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 SELENOFO60613 162 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 FAM20BO75063 409 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 GLCEO94923 617 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PTHP01270 115 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 HLA-DQA2P01906 255 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 TACSTD2P09758 323 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 ACSM4P0C7M7 580 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 COX5BP10606 129 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PCMT1P22061 227 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 ACHEP22303 614 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 CRABP1P29762 137 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 PCBD1P61457 104 aa8.67□□□□□ -1.02
HDLBP-216ENST00000428482 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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