RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSR3Q9UNL2 185 aa14.65□□□□□ -0.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GVI7 797 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 A6NHS1 94 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BSA7 217 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 P2RY10O00398 339 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYT7O43581 403 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 AIREO43918 545 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SC5DO75845 299 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GABARAPO95166 117 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD40P25942 277 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 UCP2P55851 309 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DOK3Q7L591 496 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 COMMD2Q86X83 199 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RDH10Q8IZV5 341 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHYHIPQ92561 330 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPSB4Q96A44 273 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SGK3Q96BR1 496 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51E2Q9H255 320 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.64□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GTI1 187 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GABRPO00591 440 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMPD2O60906 423 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATE1O95260 518 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OCM2P0CE71 109 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FABP5Q01469 135 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q499Y3 187 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZSR3 168 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01560Q8TB33 94 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 REEP6Q96HR9 211 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR84Q9NQS5 396 aa14.63□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 C5orf63A6NC05 138 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF879B4DU55 563 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPX5O75715 221 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NGFP01138 241 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAF1P04049 648 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD2P06729 351 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANOS1P23352 680 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CALCRP30988 508 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYZL4Q96KX0 146 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHDHQ9UQ10 334 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 STARD10Q9Y365 291 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.62□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC160A6NGH7 325 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 J3QKU1 62 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CASKO14936 926 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHRS3O75911 302 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARL6IP5O75915 188 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLA2G2AP14555 144 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NR4A1P22736 598 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1CBP62140 327 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF92Q03936 586 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTF1Q16619 201 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms