RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 EXD3Q8N9H8 876 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM127O75204 238 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 LGALS4P56470 323 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC20Q12834 499 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 TBPP20226 339 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 DCTDP32321 178 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 XAF1Q6GPH4 301 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 NRTNQ99748 197 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 P4HTMQ9NXG6 502 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIP11Q15643 1979 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 MKRN2OSH3BPM6 223 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 MGMTP16455 207 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 CLDN20P56880 219 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 HMGN3Q15651 99 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 OR8G2PQ6IF36 304 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 CSAG2Q9Y5P2 127 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR1O75083 606 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 GLRA1P23415 457 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 HRH1P35367 487 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 HAAOP46952 286 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNIP4Q6PIL6 250 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD37Q7Z713 158 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXB1Q99853 325 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 MEIKINA0A087WXM9 373 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 ALG1L2C9J202 215 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC17A2O00624 439 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 CT62P0C5K7 136 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 FAHP16930 419 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2AE1Q8NHA4 323 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 TGM6O95932 706 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 PI3P19957 117 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 S100A7P31151 101 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 GPNMBQ14956 572 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 NANPQ8TBE9 248 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM4Q8WVI0 70 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 GSX2Q9BZM3 304 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-201ENST00000418331 OR1C1Q15619 314 aa19.27■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 DMRTC1Q5HYR2 192 aa19.27■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 GNRHR2Q96P88 292 aa19.27■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM173AQ9BQD7 235 aa19.27■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 CFHR5Q9BXR6 569 aa19.27■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 TAF9BQ9HBM6 251 aa19.27■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa19.27■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB27BO00194 218 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5H8P0DN80 308 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ST3GAL6Q9Y274 331 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 HPNP05981 417 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB108BQ8NET1 73 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP23Q9Y6H3 246 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC01387J3KSC0 135 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 XRCC3O43542 346 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 OR11G2Q8NGC1 345 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNIP2Q9NS61 270 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 KLK11Q9UBX7 282 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 DHRS13Q6UX07 377 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 CD300LDQ6UXZ3 194 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC23A1Q9UHI7 598 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 RPH3ALQ9UNE2 315 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXJ3Q9UPW0 622 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHA2P01877 340 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 THBS3P49746 956 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 HPSE2Q8WWQ2 592 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 MARC2Q969Z3 335 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 PLK3Q9H4B4 646 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD34BA5PLL1 514 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2F2O95006 317 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2F1Q13607 317 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF718Q3SXZ3 478 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC190Q86UF4 302 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 MARCH1Q8TCQ1 289 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 SUCNR1Q9BXA5 334 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 M0R1B8 84 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4E1P0C645 316 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 FCGR2CP31995 323 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF85Q03923 595 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 FMODQ06828 376 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 YIPF5Q969M3 257 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 PELI1Q96FA3 418 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 PLA2G3Q9NZ20 509 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 APOA2P02652 100 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRJ-201ENST00000418331 OR8U8P0C7N1 319 aa19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms