RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.88□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 P04436 131 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.88□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 GPR37O15354 613 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 HMGA2P52926 109 aa8.88□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.88□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 EMC6Q9BV81 110 aa8.88□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.88□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 SLC35E2P0CK97 266 aa8.87□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 Q6ZN92 141 aa8.87□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 PCK2Q16822 640 aa8.86□□□□□ -0.99
HERC3-202ENST00000402738 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.86□□□□□ -0.99
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HERC3-202ENST00000402738 LHX6Q9UPM6 363 aa8.86□□□□□ -0.99
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