RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 NKX2-6A6NCS4 301 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 ZNF879B4DU55 563 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 C16orf97H3BN30 126 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 TBX1O43435 398 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 APOC1P02654 83 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 OCM2P0CE71 109 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 WNT5AP41221 380 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 OR2AE1Q8NHA4 323 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 GPR148Q8TDV2 347 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 GPR84Q9NQS5 396 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 COQ3Q9NZJ6 369 aa20.17■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GUH1 482 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 SLC22A1O15245 554 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 NGFP01138 241 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 GALP22466 123 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 APLNRP35414 380 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 PRSS12P56730 875 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 COLCA1Q6ZS62 124 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 ASB5Q8WWX0 329 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 SGK3Q96BR1 496 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 NOX4Q9NPH5 578 aa20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 Q499Y3 187 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 STEAP2Q8NFT2 490 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 DERL3Q96Q80 235 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 DCSTAMPQ9H295 470 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 OBP2BQ9NPH6 170 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 NPAP1Q9NZP6 1156 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 AMDHD2Q9Y303 409 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 A6NIN4 97 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 SERPINA3P01011 423 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 C4orf17Q53FE4 359 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 TMEM244Q5VVB8 128 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 KCTD7Q96MP8 289 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 ETAA1Q9NY74 926 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 HHLA2Q9UM44 414 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 FLNCQ14315 2725 aa20.15■□□□□ 0.82
CNN3-202ENST00000394202 SMIM30A4D0T7 59 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 IGLV1-44P01699 117 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 IGLV3-1P01715 115 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 CLEC2LP0C7M8 214 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 CECR9P0C854 216 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 ACHEP22303 614 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 GRNP28799 593 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 SDC2P34741 201 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 SERPINB10P48595 397 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 COMMD2Q86X83 199 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 OR52H1Q8NGJ2 320 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 TMEM106AQ96A25 262 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 OR51B6Q9H340 312 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 SYT7O43581 403 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 UCHL1P09936 223 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 RPS19P39019 145 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 ASCL1P50553 236 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 ZNF83P51522 516 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 MXD1Q05195 221 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 PPA1Q15181 289 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 ASPHD2Q6ICH7 369 aa20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 A0A0U1RQV5 110 aa20.13■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 GATBO75879 557 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 CDRT1O95170 752 aa20.13■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa20.13■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 MUCL1Q96DR8 90 aa20.13■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 OR10A2Q9H208 303 aa20.13■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 TPK1Q9H3S4 243 aa20.13■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 STARD10Q9Y365 291 aa20.13■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 ZG16O60844 167 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 EPXP11678 715 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 ZNF92Q03936 586 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 TBC1D28Q2M2D7 210 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 USP43Q70EL4 1123 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 OR13C3Q8NGS6 347 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 POFUT1Q9H488 388 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 OCEL1Q9H607 264 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 DHDHQ9UQ10 334 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 CADP27708 2225 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GVI7 797 aa20.12■□□□□ 0.81
CNN3-202ENST00000394202 THBDP07204 575 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms