RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384671.1

RNU6-959P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 959, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-959P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-959P-201ENST00000384671 ISPDA4D126 451 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 DPM1O60762 260 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 RDH16O75452 317 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ABHD2P08910 425 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 RBM34P42696 430 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TWF1Q12792 350 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 NCF4Q15080 339 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 NIPAL3Q6P499 406 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 KCNIP4Q6PIL6 250 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 C16orf54Q6UWD8 224 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM144Q7Z5S9 345 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 EXOC8Q8IYI6 725 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 C3orf22Q8N5N4 141 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZIC4Q8N9L1 334 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR10G6Q8NH81 332 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 EXOC6Q8TAG9 804 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SPACA4Q8TDM5 124 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SERPINB12Q96P63 405 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CLCC1Q96S66 551 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PEBP4Q96S96 227 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM117Q9H0C3 514 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 COMMD8Q9NX08 183 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SMIM26A0A096LP01 95 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 A0A1W2PRV1 198 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRGV3P03979 118 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TALDO1P37837 337 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 RND2P52198 227 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 IRF8Q02556 426 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 NOXRED1Q6NXP6 359 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 WDR88Q6ZMY6 472 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ERASQ7Z444 233 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 NUDCD3Q8IVD9 361 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 RNF148Q8N7C7 305 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC25A29Q8N8R3 303 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ACBD4Q8NC06 268 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 KCNG3Q8TAE7 436 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 FAM3CQ92520 227 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 RIT2Q99578 217 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ATG10Q9H0Y0 220 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 VAX2Q9UIW0 290 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CES1P1Q9UKY3 287 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 GRIFINA4D1Z8 144 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCL21O00585 134 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 LDHCP07864 332 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CHIT1Q13231 466 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 C1orf61Q13536 156 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 FILIP1LQ4L180 1135 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TIMM23BQ5SRD1 257 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CYHR1Q6ZMK1 362 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 LRRC8AQ8IWT6 810 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 LFNGQ8NES3 379 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR10T2Q8NGX3 314 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 FXYD5Q96DB9 178 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CXorf40BQ96DE9 158 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 EEF2KMTQ96G04 330 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC23A2Q9UGH3 650 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 RAB22AQ9UL26 194 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TTLL3Q9Y4R7 772 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 A8MUN3 132 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TAAR5O14804 337 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRAPPC3O43617 180 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 OPN1SWP03999 348 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PSMB9P28065 219 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 GNA11P29992 359 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CFHR2P36980 270 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 RPS15P62841 145 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CD164Q04900 197 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 QPRTQ15274 297 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 DGUOKQ16854 277 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 MLIPQ5VWP3 458 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 C11orf72Q8NBR9 251 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 FAM71CQ8NEG0 241 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR1F12Q8NHA8 337 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 MAIP1Q8WWC4 291 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 C7orf34Q96L11 122 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TTC25Q96NG3 672 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ASB3Q9Y575 518 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 NPTNQ9Y639 398 aa-1.77□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms