RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ISPDA4D126 451 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZAR1LA6NP61 321 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 EI24O14681 340 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GLCEO94923 617 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 APOC1P02654 83 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SPI1P17947 270 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF1AP19438 455 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GSTT1P30711 240 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PYCR1P32322 319 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 THBS2P35442 1172 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GGT2P36268 569 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC15A1P46059 708 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ENTPD1P49961 510 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 POU4F2Q12837 409 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TMED1Q13445 227 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TEX30Q5JUR7 227 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SHFQ7M4L6 423 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR5AS1Q8N127 324 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CBR4Q8N4T8 237 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PTP4A1Q93096 173 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SPTSSAQ969W0 71 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OTULINQ96BN8 352 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HAVCR1Q96D42 359 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MNTQ99583 582 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CIB1Q99828 191 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GAL3ST1Q99999 423 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SP140LQ9H930 580 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 IL19Q9UHD0 177 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TVP23AA6NH52 213 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 F5H5K5 113 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PNPP00491 289 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV2-70P01814 119 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GYPBP06028 91 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ACSM4P0C7M7 580 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PSKH1P11801 424 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ANPEPP15144 967 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RCN1Q15293 331 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL12Q53G59 568 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T2Q6IF00 324 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PHC2Q8IXK0 858 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM163Q8TC26 289 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MAP6Q96JE9 813 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 Q96MT0 163 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR2V2Q96R30 315 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CITED4Q96RK1 184 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 INTS14Q96SY0 518 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DDOQ99489 341 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TOR3AQ9H497 397 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 WDR76Q9H967 626 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 NPTNQ9Y639 398 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0G2JMP0 313 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0X1KG70 313 aa6.46□□□□□ -1.38
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