RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359276.8

CTPS2-201, Transcript of CTP synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS2, Length 3,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2-201ENST00000359276 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 NICN1Q9BSH3 213 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CRLF2Q9HC73 371 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 PDE7BQ9NP56 450 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 MMP25Q9NPA2 562 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 LRP12Q9Y561 859 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 VCANP13611 3396 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 PHOX2AO14813 284 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 TNFSF12O43508 249 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 QDPRP09417 244 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CEBPBP17676 345 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 SCAND1P57086 179 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 TMEM33P57088 247 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 TOMM40LQ969M1 308 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 DIRAS3O95661 229 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF77Q15935 545 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 LUZP4Q9P127 313 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 NKX2-2O95096 273 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 UBE2KP61086 200 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 SP3Q02447 781 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ACKR1Q16570 336 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 PYY3Q5JQD4 70 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 SLC43A2Q8N370 569 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 RNF128Q8TEB7 428 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 C2orf50Q96LR7 162 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 OR2A5Q96R48 311 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 TMEM100Q9NV29 134 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 TREM2Q9NZC2 230 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CEACAM5P06731 702 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 SLC25A1P53007 311 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 HMGN3Q15651 99 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CEBPEQ15744 281 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 MED25Q71SY5 747 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 NMES1Q9C002 83 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 NELFAQ9H3P2 528 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 COL4A3Q01955 1670 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 A0A087X0M5 115 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 A0A1B0GX30 115 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 BTBD17A6NE02 478 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 F8VVB4 439 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 F8VWA3 439 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 PNMTP11086 282 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 OMGP23515 440 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 G0S2P27469 103 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 BTG2P78543 158 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CST6Q15828 149 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 TAAR8Q969N4 342 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 RAB27BO00194 218 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 AGAP20933 346 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 HAGHQ16775 308 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 C2orf27AQ580R0 203 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 C17orf51A8MQB3 221 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF205O95201 554 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 BCORP1Q8N888 145 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 DOK5Q9P104 306 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS2-201ENST00000359276 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms