RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 TBX21Q9UL17 535 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0A6YYD5 115 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 SSSCA1O60232 199 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 RAG2P55895 527 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 BTN1A1Q13410 526 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf76Q3KRA6 126 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 DUSP13Q9UII6 198 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0B4J2E0 115 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GX12 115 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 SOCS6O14544 535 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 OR1D5P58170 312 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF511Q8NB15 262 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 OR8U1Q8NH10 309 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CREBBPQ92793 2442 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ARID2Q68CP9 1835 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 XRCC3O43542 346 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 QDPRP09417 244 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 SHC1P29353 583 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 THBS4P35443 961 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 C21orf58P58505 322 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 PPIAP62937 165 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 BTG2P78543 158 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CDK5R1Q15078 307 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 LYG2Q86SG7 212 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 PIGTQ969N2 578 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 REEP6Q96HR9 211 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ARPC3O15145 178 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CTSLP07711 333 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 MMP15P51511 669 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CLDN12P56749 244 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CLDN20P56880 219 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 FUT7Q11130 342 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 MED9Q9NWA0 146 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CACNA1BQ00975 2339 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ZFP92A6NM28 416 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 GPR31O00270 319 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 GALNT16Q8N428 558 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PR48 441 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 M0QYG6 137 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ICOSLGO75144 302 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 GP1BAP07359 652 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 FXNQ16595 210 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CDONQ4KMG0 1287 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 VHLLQ6RSH7 139 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 HRASP01112 189 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 FAM117AQ9C073 453 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 PAX6P26367 422 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CALCRP30988 508 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 OR5M11Q96RB7 305 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 C12orf49Q9H741 205 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 TFAP2AP05549 437 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 RRASP10301 218 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 EDDM3AQ14507 147 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 SLC17A1Q14916 467 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 MENTQ9BUN1 341 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS44E7EML9 344 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-201ENST00000356100 NME2P22392 152 aa5.45□□□□□ -1.54
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