RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ACTBL2Q562R1 376 aa15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC35D2Q76EJ3 337 aa15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 C10orf53Q8N6V4 93 aa15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR13H1Q8NG92 308 aa15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 AQP3Q92482 292 aa15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 UCK1Q9HA47 277 aa15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CKLFQ9UBR5 152 aa15.02□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 A0A087WUJ7 227 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 IFNA6P05013 189 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 LYL1P12980 280 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 NDUFA6P56556 154 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TAS2R60P59551 318 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CTXN1P60606 82 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PHF19Q5T6S3 580 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CHST4Q8NCG5 386 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 THRSPQ92748 146 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 S1PR5Q9H228 398 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HRASLS2Q9NWW9 162 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 S100A10P60903 97 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SPOCK1Q08629 439 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 C1orf61Q13536 156 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SSX2Q16385 188 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MEP1BQ16820 701 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 C1QL4Q86Z23 238 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PILRAQ9UKJ1 303 aa15.01□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 UMAD1C9J7I0 102 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 H7C1Q1 480 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 LDLRAD4O15165 306 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 APBB3O95704 486 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TSPAN15O95858 294 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PNPP00491 289 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RPS10P46783 165 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 REC114Q7Z4M0 266 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZNF615Q8N8J6 731 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR4N2Q8NGD1 307 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR10D4PQ8NGN7 298 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR1J1Q8NGS3 322 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 STARD10Q9Y365 291 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 A0A0A6YYH2 397 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 A6NJ64 397 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TERTO14746 1132 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PMP2P02689 132 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZNF260Q3ZCT1 412 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MIDNQ504T8 468 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TMEM268Q5VZI3 342 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 BEND4Q6ZU67 534 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CD300LFQ8TDQ1 290 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR10C1Q96KK4 312 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 FOXN4Q96NZ1 517 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 INTS14Q96SY0 518 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TGIF2Q9GZN2 237 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PARPBPQ9NWS1 579 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1D-16P01601 117 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GUK1Q16774 197 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ALG10Q5BKT4 473 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ASB5Q8WWX0 329 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ADAM19Q9H013 955 aa15□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MPDZO75970 2070 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RAB27BO00194 218 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TAS2R31P59538 309 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RHEBQ15382 184 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SSX3Q99909 188 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 DOK5Q9P104 306 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 A0A087WV62 115 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TNFSF14O43557 240 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 NME2P1O60361 137 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PI3P19957 117 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GAMTQ14353 236 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MESTQ5EB52 335 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZNF550Q7Z398 422 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 LYPD6BQ8NI32 183 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms