RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 ABOP16442 354 aa9.64□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 CAPZA2P47755 286 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 CX3CR1P49238 355 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 ZMYND11Q15326 602 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 TRAM1Q15629 374 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.64□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 AP3S1Q92572 193 aa9.64□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 NUP50Q9UKX7 468 aa9.64□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF45Q02386 682 aa9.63□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 TRIB1Q96RU8 372 aa9.63□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF175Q9Y473 711 aa9.63□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.62□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.62□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.62□□□□□ -0.87
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GGPS1-201ENST00000282841 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 OR51D1Q8NGF3 324 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.62□□□□□ -0.87
GGPS1-201ENST00000282841 ABHD1Q96SE0 405 aa9.62□□□□□ -0.87
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