RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 DNM1P34Q6PK57 102 aa13.28□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 RNF144BQ7Z419 303 aa13.28□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.28□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa13.28□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 KCNK17Q96T54 332 aa13.28□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 UQCC2Q9BRT2 126 aa13.28□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 TMEM231Q9H6L2 316 aa13.28□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 PDE7BQ9NP56 450 aa13.28□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 CUTCQ9NTM9 273 aa13.28□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 A6NIZ1 184 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 TMEM14DPA8MWL7 114 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 OR2T1O43869 369 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 DRD1P21728 446 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 AKR1D1P51857 326 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 TAS2R31P59538 309 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 RAP1BP61224 184 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 RAP1AP62834 184 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 MST1LQ2TV78 715 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 KIAA0895LQ68EN5 471 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 TMEM230Q96A57 120 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 MMP26Q9NRE1 261 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 LHX6Q9UPM6 363 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 A0A0A6YYD4 124 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 MSGN1A6NI15 193 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 NPIPA5E9PKD4 350 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SYT7O43581 403 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 FASLGP48023 281 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 NPBWR1P48145 328 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 GSK3AP49840 483 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 RAB13P51153 203 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CLDN6P56747 220 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CYCSP99999 105 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 STK11Q15831 433 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 TMEM128Q5BJH2 165 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 AWAT2Q6E213 333 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 COX15Q7KZN9 410 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ANGPTL5Q86XS5 388 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SPAG16Q8N0X2 631 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 BHLHE23Q8NDY6 225 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 PBOV1Q9GZY1 135 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 C5orf66Q9H5L9 145 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 NPIPA1Q9UND3 350 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 PIAS3Q9Y6X2 628 aa13.27□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 NUDT19A8MXV4 375 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ADAM10O14672 748 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SCGNO76038 276 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 BLKP51451 505 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SGCAQ16586 387 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ZNF528Q3MIS6 628 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ZNF529Q6P280 563 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 TERB2Q8NHR7 220 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SLAMF6Q96DU3 332 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CYYR1Q96J86 154 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ARL5BQ96KC2 179 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 TREM1Q9NP99 234 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 MED29Q9NX70 200 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 GPR132Q9UNW8 380 aa13.26□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ADAP1O75689 374 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 RFC3P40938 356 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 EMP2P54851 167 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CDC6Q99741 560 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 MICU1Q9BPX6 476 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SEC11CQ9BY50 192 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 LPAR5Q9H1C0 372 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 UQCC1Q9NVA1 299 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 PRR13Q9NZ81 148 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CYP8B1Q9UNU6 501 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 PCDH15Q96QU1 1955 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SNAPINO95295 136 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 DAP3P51398 398 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CCR5P51681 352 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ZP4Q12836 540 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SLC9A3R2Q15599 337 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 PLAC9Q5JTB6 97 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ZNF101Q8IZC7 436 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 C11orf40Q8WZ69 217 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 KLHDC7BQ96G42 594 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SPACA5Q96QH8 159 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ACKR4Q9NPB9 350 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 OR5AC2Q9NZP5 309 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ANAPC10Q9UM13 185 aa13.25□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 TLCD2A6NGC4 264 aa13.24□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 H3BMH7 237 aa13.24□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SFT2D2O95562 160 aa13.24□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 LYL1P12980 280 aa13.24□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 NPY4RP50391 375 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms