RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 ZNF154Q13106 437 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SLC35D3Q5M8T2 416 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 LOXL4Q96JB6 756 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SEMA4GQ9NTN9 838 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 EDDM3BP56851 147 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 LIPHQ8WWY8 451 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OXGR1Q96P68 337 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 AREGP15514 252 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 S100A11P31949 105 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 DRD3P35462 400 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 EMP3P54852 163 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 B4GALNT1Q00973 533 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 PRTGQ2VWP7 1150 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR2T2Q6IF00 324 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR5M9Q8NGP3 310 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 NICN1Q9BSH3 213 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 AK3Q9UIJ7 227 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TGM1P22735 817 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 UCNP55089 124 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 CLDN12P56749 244 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ZNF90Q03938 601 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 LTBQ06643 244 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 DUSP8Q13202 625 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 MPPED2Q15777 294 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 PFN4Q8NHR9 129 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 GDF15Q99988 308 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TK1P04183 234 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 QDPRP09417 244 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 NME2P22392 152 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 HBG1P69891 147 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 HBG2P69892 147 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 COL19A1Q14993 1142 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ETFDHQ16134 617 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR2M3Q8NG83 312 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 CT55Q8WUE5 264 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.87□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 P2RY10O00398 339 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 HMGN4O00479 90 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TEKQ02763 1124 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ZNF92Q03936 586 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ZNF266Q14584 549 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TPPP3Q9BW30 176 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 GPR87Q9BY21 358 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 AKR7A2O43488 359 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TAS2R19P59542 299 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 DUSP2Q05923 314 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 CATR1Q13166 79 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ACOD1A6NK06 481 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SIX6O95475 246 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 LCN10Q6JVE6 187 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR5AS1Q8N127 324 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 GHSRQ92847 366 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ALG14Q96F25 216 aa9.86□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms