RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 A0A0J9YW62 118 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CIB4A0PJX0 185 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 I3L521 148 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 L7N2F9 121 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ACOT7O00154 380 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR3A4PP47883 348 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CCR9P51686 369 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SORDQ00796 357 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 COL19A1Q14993 1142 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CDC20BQ86Y33 519 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 DYRK2Q92630 601 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ADAM19Q9H013 955 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 COMMD9Q9P000 198 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ACSM4P0C7M7 580 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 AMY2BP19961 511 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 BDKRB2P30411 391 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MAGEA5P43359 124 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MRGPREQ86SM8 312 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HOXB5P09067 269 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF35P13682 527 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 VHLLQ6RSH7 139 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CDH24Q86UP0 819 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 KMT5CQ86Y97 462 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ASB5Q8WWX0 329 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ST8SIA1Q92185 356 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MAP6Q96JE9 813 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SGCZQ96LD1 299 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MED18Q9BUE0 208 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 USF3Q68DE3 2245 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OGG1O15527 345 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 UMODP07911 640 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF611Q8N823 705 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR10D3Q8NH80 312 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 GGT3PA6NGU5 568 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 GPR171O14626 319 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PEX14O75381 377 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FAM157BP0CG42 384 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC35A1P78382 337 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RSU1Q15404 277 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 LYPD8Q6UX82 237 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TMEM104Q8NE00 496 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR2M3Q8NG83 312 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ASB10Q8WXI3 467 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CLDN23Q96B33 292 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 GLTPQ9NZD2 209 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ABI3Q9P2A4 366 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FZR1Q9UM11 496 aa6.66□□□□□ -1.34
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