RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	HIST1H3A	P68431	136 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	RELB	Q01201	579 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	KCNMB1	Q16558	191 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	LNX2	Q8N448	690 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	COQ7	Q99807	217 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	CRABP1	P29762	137 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	RAG2	P55895	527 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	OR8G1	Q15617	311 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	GPR157	Q5UAW9	335 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078		Q6YL49	198 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	ADCK1	Q86TW2	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	SLITRK2	Q9H156	845 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	C1RL	Q9NZP8	487 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	SRRM5	B3KS81	715 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	ADAM20	O43506	726 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	TOX4	O94842	621 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	REN	P00797	406 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	GRP	P07492	148 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	NUDT2	P50583	147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	COX10	Q12887	443 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	OR8B8	Q15620	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	PGAP1	Q75T13	922 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	FGFRL1	Q8N441	504 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	LHX4	Q969G2	390 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	IFT27	Q9BW83	186 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	BEX1	Q9HBH7	125 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-262	ENST00000628078	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TG	P01266	2768 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PRQ8	180 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	OR6C68	A6NDL8	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TVP23A	A6NH52	213 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	TXNDC12	O95881	172 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GYPA	P02724	150 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	MELTF	P08582	738 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	RHCE	P18577	417 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PYCR1	P32322	319 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	GGT2	P36268	569 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	CFHR2	P36980	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	PSMB10	P40306	273 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ARF6	P62330	175 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF92	Q03936	586 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	MALL	Q13021	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	DGCR6	Q14129	220 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	RFX4	Q33E94	735 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-262	ENST00000628078	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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