RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613965.1

MFGE8-216, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 5

Gene MFGE8, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-216ENST00000613965 UPRTQ96BW1 309 aa8.53□□□□□ -1.04
MFGE8-216ENST00000613965 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.53□□□□□ -1.04
MFGE8-216ENST00000613965 FUZQ9BT04 418 aa8.53□□□□□ -1.04
MFGE8-216ENST00000613965 MIOXQ9UGB7 285 aa8.53□□□□□ -1.04
MFGE8-216ENST00000613965 B9D1Q9UPM9 204 aa8.53□□□□□ -1.04
MFGE8-216ENST00000613965 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 LRRC30A6NM36 301 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CLDN34H7C241 214 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FSTL3O95633 263 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PLATP00750 562 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 HLA-DPB1P04440 258 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ACSM4P0C7M7 580 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FPR3P25089 353 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PMELP40967 661 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SPIBQ01892 262 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF404Q494X3 552 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FITM2Q8N6M3 262 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FANK1Q8TC84 345 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 NMNAT3Q96T66 252 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PITX2Q99697 317 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR52D1Q9H346 318 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM100Q9NV29 134 aa8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 F5H5K5 113 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ARPC3O15145 178 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 KCNAB3O43448 404 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 GADD45GO95257 159 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 RENP00797 406 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FABP3P05413 133 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CALB2P22676 271 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SLC6A6P31641 620 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 GATA4P43694 442 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MTNR1AP48039 350 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PITPNBP48739 271 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MAB21L1Q13394 359 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 RFX4Q33E94 735 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 NAA40Q86UY6 237 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR4K13Q8NH42 304 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 NSL1Q96IY1 281 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR8B2Q96RD0 313 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ATF6BQ99941 703 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MUC13Q9H3R2 512 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CLN8Q9UBY8 286 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.51□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 OR6C68A6NDL8 312 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 B2RBV5 119 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PHYHO14832 338 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 FAM20BO75063 409 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 LCATP04180 440 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 IRF2P14316 349 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ATP6V1B2P21281 511 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 RRM2P31350 389 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 GGT2P36268 569 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 IFNGR2P38484 337 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CD200P41217 278 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 IL13RA1P78552 427 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ECH1Q13011 328 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MALLQ13021 153 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MPPED2Q15777 294 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SLC36A3Q495N2 470 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.5□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.5□□□□□ -1.05
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