RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 PRKACGP22612 351 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 POU1F1P28069 291 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 MALLQ13021 153 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 INTS14Q96SY0 518 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 BEX2Q9BXY8 128 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 COL6A5A8TX70 2615 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 LCATP04180 440 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 GSTT1P30711 240 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 MVKQ03426 396 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 SPRNQ5BIV9 151 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 AVPI1Q5T686 147 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 OR2T2Q6IF00 324 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 CCL17Q92583 94 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 RAB39BQ96DA2 213 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 KCNJ15Q99712 375 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 COPS4Q9BT78 406 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 TEX12Q9BXU0 123 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 MED20Q9H944 212 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 FAM157AC9JC47 383 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 IFNL4K9M1U5 179 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 IFNA2P01563 188 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 IGHV2-5P01817 119 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 MSMBP08118 114 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 FCGR1AP12314 374 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 SLC15A1P46059 708 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 SLC6A9P48067 706 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 ASRGL1Q7L266 308 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 SHFQ7M4L6 423 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 NAA40Q86UY6 237 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 TIGD4Q8IY51 512 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 OR5AS1Q8N127 324 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 OR2V2Q96R30 315 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 TOR3AQ9H497 397 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 OPA3Q9H6K4 179 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 TREM2Q9NZC2 230 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-214ENST00000601319 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 MLNRO43193 412 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 FASP25445 335 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 THBS2P35442 1172 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 ESRRGP62508 458 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 CR1LQ2VPA4 569 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 PGAP1Q75T13 922 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 OR51F2Q8NH61 342 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 OTULINQ96BN8 352 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 AP4S1Q9Y587 144 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 G3V2T6 193 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 CIB2O75838 187 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 IGHV2-70P01814 119 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 APOC1P02654 83 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 ANPEPP15144 967 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 SLC2A5P22732 501 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 DAPP51397 102 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 MMP16P51512 607 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 CRISP1P54107 249 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 TAF13Q15543 124 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 TMEM186Q96B77 213 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-214ENST00000601319 ABHD6Q9BV23 337 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms