RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF682O95780 498 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 TXNDC12O95881 172 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 LIPFP07098 398 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SFTPBP07988 381 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CRABP1P29762 137 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 OMPP47874 163 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS12P56730 875 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 PDCD1Q15116 288 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 MPPED2Q15777 294 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CORO6Q6QEF8 472 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 TECTBQ96PL2 329 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 TBX15Q96SF7 602 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PRQ8 180 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 F5H5K5 113 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 TOX4O94842 621 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINA1P01009 418 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ACSM4P0C7M7 580 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CENPAP49450 140 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS6KA3P51812 740 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP10-3P60369 221 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 DGCR6Q14129 220 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNJ8Q15842 424 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CD276Q5ZPR3 534 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 DYRK2Q92630 601 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 RCN3Q96D15 328 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 WDFY2Q96P53 400 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ATF6BQ99941 703 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF114Q9Y508 228 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 LGALS8O00214 317 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 CLPXO76031 633 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R3DO95685 299 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 H1F0P07305 194 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 LIPEQ05469 1076 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ECH1Q13011 328 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 MALLQ13021 153 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 OR8G1Q15617 311 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 FGD3Q5JSP0 725 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 PGAP1Q75T13 922 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 NAA40Q86UY6 237 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 OR6V1Q8N148 313 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC01006Q8NI28 216 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 PITX2Q99697 317 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM15Q9C019 465 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A4Q9H015 551 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SIRPDQ9H106 197 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 ARMCX1Q9P291 453 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF7Q9UBF6 113 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 B9D1Q9UPM9 204 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 AURKCQ9UQB9 309 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-226ENST00000593200 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms