RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	SBK2	P0C263	348 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ANXA8	P13928	327 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC15A1	P46059	708 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ERF	P50548	548 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	RAD23A	P54725	363 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV2-5	P01817	119 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	HMGN1	P05114	100 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	CLU	P10909	449 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	OSM	P13725	252 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	THBS2	P35442	1172 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	BNIP1	Q12981	228 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SCGB2A2	Q13296	93 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPRN	Q5BIV9	151 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	DRAM2	Q6UX65	266 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	NAA40	Q86UY6	237 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	LRRC30	A6NM36	301 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF878	C9JN71	531 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	HSD11B1	P28845	292 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	GSTT1	P30711	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRKX	P51817	358 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	GINS1	Q14691	196 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SHF	Q7M4L6	423 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCNJ15	Q99712	375 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SP140L	Q9H930	580 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	MED20	Q9H944	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A0G2JMP0	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A0X1KG70	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PLPP2	O43688	288 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	GLCE	O94923	617 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PNP	P00491	289 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	APOC1	P02654	83 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	IRF2	P14316	349 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRKACG	P22612	351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	LIPN	Q5VXI9	398 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPATC1	Q76KD6	591 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825	GCM1	Q9NP62	436 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-215	ENST00000589825		F5H5P2	479 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825		H0YL77	283 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	FOXH1	O75593	365 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRSS12	P56730	875 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	BTG1	P62324	171 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR8G1	Q15617	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms