RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 ACER3Q9NUN7 267 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 GID8Q9NWU2 228 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 IFT52Q9Y366 437 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM72A0PK05 275 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 CD8B2A6NJW9 211 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 M0QX08 132 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 SMPD2O60906 423 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 AQP8O94778 261 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 MFN2O95140 757 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 PMS2P2O95744 297 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 NPPAP01160 153 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 ME2P23368 584 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 HTR2AP28223 471 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 SLC6A8P48029 635 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 SLC7A2P52569 658 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 CRYBA2P53672 197 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 LIPEQ05469 1076 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 RBBP4Q09028 425 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 SELENBP1Q13228 472 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 ETFDHQ16134 617 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 HBMQ6B0K9 141 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 OR2T12Q8NG77 320 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 LINC01560Q8TB33 94 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM234Q8WY98 164 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 OR5B2Q96R09 309 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF607Q96SK3 696 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 SH3GL1Q99961 368 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 CALHM2Q9HA72 323 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4D-210ENST00000588972 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PPR1 153 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS46E5RG02 174 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 FAAHO00519 579 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TPST2O60704 377 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SERPINB7O75635 380 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RAD51DO75771 328 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 UQCRBP14927 111 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PTNP21246 168 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PRDX6P30041 224 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 MNDAP41218 407 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SLC1A3P43003 542 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR3A1P47881 315 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 GSK3BP49841 420 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PSME3P61289 254 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 BNIP2Q12982 314 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.362e-7■■■□□ 16.7
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 DUSP7Q16829 419 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF550Q7Z398 422 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 GRINAQ7Z429 371 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 MMD2Q8IY49 270 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 MICU2Q8IYU8 434 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RNF148Q8N7C7 305 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OSTF1Q92882 214 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ARL5BQ96KC2 179 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GWA3 101 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PNV4 684 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 GJE1A6NN92 205 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TXNL1O43396 289 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TNFSF13O75888 250 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RCBTB2O95199 551 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SYNGR4O95473 234 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TOMM40O96008 361 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 NCK1P16333 377 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF12P17014 697 aa6.57□□□□□ -1.36
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