RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 MARCH7Q9H992 704 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL19Q9UHD0 177 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TVP23AA6NH52 213 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 EREGO14944 169 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 FKBP6O75344 327 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 FSTL3O95633 263 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 IFNGP01579 166 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGHV2-5P01817 119 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 HLA-DQA2P01906 255 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 MSMBP08118 114 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANXA8P13928 327 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF823P16415 610 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 SELEP16581 610 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 SRD5A1P18405 259 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TNFRSF1AP19438 455 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 HNF1AP20823 631 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 PCMT1P22061 227 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 FMO3P31513 532 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 GRK5P34947 590 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ENTPD1P49961 510 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 BLVRAP53004 296 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TPTEP56180 551 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 CDK5Q00535 292 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCNIQ14094 377 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR2T2Q6IF00 324 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ST7LQ8TDW4 575 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCL17Q92583 94 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAB1CQ92928 201 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM186Q96B77 213 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 NRBF2Q96F24 287 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TIMD4Q96H15 378 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 YY1AP1Q9H869 796 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 WDR76Q9H967 626 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 NTN4Q9HB63 628 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TREM2Q9NZC2 230 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 F5H5K5 113 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 IFNL4K9M1U5 179 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 M0R135 149 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 SURF4O15260 269 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 MLNRO43193 412 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATP5HO75947 161 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGHV2-70P01814 119 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 GYPBP06028 91 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLUP10909 449 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 OSMP13725 252 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANPEPP15144 967 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF3P17036 446 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANOS1P23352 680 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TNFSF4P23510 183 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 GATA4P43694 442 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 CBX1P83916 185 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 MVKQ03426 396 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 AVPI1Q5T686 147 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 DRAM2Q6UX65 266 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 NAA40Q86UY6 237 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPATA24Q86W54 205 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 TIGD4Q8IY51 512 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR51F2Q8NH61 342 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAB39BQ96DA2 213 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms