RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.69□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 NTNG2Q96CW9 530 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 DDOQ99489 341 aa7.68□□□□□ -1.18
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