RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543818.5

LRTM2-208, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,986 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRTM2-208	ENST00000543818	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ETV7	Q9Y603	341 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818		H7C417	338 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	HEXB	P07686	556 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	MR1	Q95460	341 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	NMNAT3	Q96T66	252 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CYB5B	O43169	146 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	SELENOF	O60613	162 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	AMY2B	P19961	511 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	SPOCK1	Q08629	439 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	FBP1	P09467	338 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ZNF823	P16415	610 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	S1PR1	P21453	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	OR10A5	Q9H207	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ZNF726	A6NNF4	738 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818		G3V3Y1	287 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	TNFSF12	O43508	249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	JMJD7	P0C870	316 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CALCB	P10092	127 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	SERPINA2	P20848	420 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CAPZB	P47756	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CCR5	P51681	352 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	DOC2B	Q14184	412 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	LRFN1	Q9P244	771 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	COL6A3	P12111	3177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818		A0A1W2PPE2	198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	RAB38	P57729	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	MPPED2	Q15777	294 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	LAMA1	P25391	3075 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	TGOLN2	O43493	480 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CTNS	O60931	367 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CLN5	O75503	358 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	F13B	P05160	661 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	FOLR1	P15328	257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	TBXA2R	P21731	343 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818		H7C1C5	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	HSPA12A	O43301	675 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	DOK2	O60496	412 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	PI3	P19957	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	CXCR1	P25024	350 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	LCN6	P62502	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	SLC22A25	Q6T423	547 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	MED25	Q71SY5	747 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LRTM2-208	ENST00000543818	OR4C3	Q8NH37	302 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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