RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	CCNB2	O95067	398 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ABHD16A	O95870	558 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	SEMG1	P04279	462 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	HNF1A	P20823	631 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	TUBG1	P23258	451 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	LAP3	P28838	519 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	HTR5A	P47898	357 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CENPA	P49450	140 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	UCP2	P55851	309 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	TEK	Q02763	1124 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	GLO1	Q04760	184 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	MEST	Q5EB52	335 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	LCN8	Q6JVE9	175 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	FAM122B	Q7Z309	247 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	PARP8	Q8N3A8	854 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	NABP1	Q96AH0	204 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	RASD2	Q96D21	266 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ASB9	Q96DX5	294 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CHID1	Q9BWS9	393 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	SYT4	Q9H2B2	425 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	OR51B6	Q9H340	312 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	REEP1	Q9H902	201 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	NUP50	Q9UKX7	468 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	FZR1	Q9UM11	496 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ISPD	A4D126	451 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	TNFRSF11B	O00300	401 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	IMPA2	O14732	288 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ARPC3	O15145	178 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CCNK	O75909	580 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	PPP1R3D	O95685	299 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	TXNDC12	O95881	172 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	IFNA2	P01563	188 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	COX5B	P10606	129 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CCL2	P13500	99 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF250	P15622	560 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CTLA4	P16410	223 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ATP6V1B2	P21281	511 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	PCMT1	P22061	227 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	MYF6	P23409	242 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	TNFSF4	P23510	183 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	GIF	P27352	417 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	LIPA	P38571	399 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	OPRL1	P41146	370 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ALDH3B1	P43353	468 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	RGS6	P49758	472 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	PPP1CB	P62140	327 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	PSG4	Q00888	419 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	TSPAN31	Q12999	210 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	FHL1	Q13642	323 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CDK10	Q15131	360 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	SEC23B	Q15437	767 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	SLC36A3	Q495N2	470 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ZFP69	Q49AA0	526 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	FAM166A	Q6J272	317 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF774	Q6NX45	483 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ACER3-213	ENST00000533873	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		5.9	□□□□□ -1.46

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