RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531920.6

MED17-208, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 3

Gene MED17, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-208	ENST00000531920	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	OR6X1	Q8NH79	312 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	RCN3	Q96D15	328 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	REEP1	Q9H902	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	NANOG	Q9H9S0	305 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CTSF	Q9UBX1	484 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920		A6NDX4	124 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	TVP23A	A6NH52	213 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920		K7EN84	100 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	DFFA	O00273	331 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	LAD1	O00515	517 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	VAPB	O95292	243 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	SMC2	O95347	1197 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	LCA5L	O95447	670 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	GCG	P01275	180 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	RHOC	P08134	193 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CD3G	P09693	182 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	GFAP	P14136	432 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CD9	P21926	228 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	PFN2	P35080	140 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	PPIC	P45877	212 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	STX3	Q13277	289 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	GINS1	Q14691	196 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	TNXA	Q16473	311 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	RNF212	Q495C1	297 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	RAB43	Q86YS6	212 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920		Q8N9W7	124 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	OR51A7	Q8NH64	312 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CDKL2	Q92772	493 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	ZNF681	Q96N22	645 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	NRTN	Q99748	197 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	GABRG3	Q99928	467 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	BBS2	Q9BXC9	721 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	GMEB1	Q9Y692	573 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	SBNO1	A3KN83	1393 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	MGAT4D	A6NG13	374 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920		E7EWF7	191 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CA11	O75493	328 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	TRAPPC6A	O75865	159 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	IGLV1-47	P01700	117 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	RAB3A	P20336	220 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	BGN	P21810	368 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	ARL2	P36404	184 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	HCAR3	P49019	387 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	UBE2E1	P51965	193 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	NDUFA8	P51970	172 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CDKN2D	P55273	166 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	HERVK_113	P61574	105 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	PSG7	Q13046	419 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	ZNF79	Q15937	498 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	TAL2	Q16559	108 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CPTP	Q5TA50	214 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	SPINK14	Q6IE38	97 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	COPS6	Q7L5N1	327 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	OR2T29	Q8NH02	315 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	SEH1L	Q96EE3	360 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	GALNT14	Q96FL9	552 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CPB2	Q96IY4	423 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	BEX2	Q9BXY8	128 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	SYT4	Q9H2B2	425 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	RGS18	Q9NS28	235 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	CACNG2	Q9Y698	323 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MED17-208	ENST00000531920	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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