RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 A0A1B0GVI7 797 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CIB4A0PJX0 185 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SYT7O43581 403 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 RAB3BP20337 219 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 COX5AP20674 150 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 PEX19P40855 299 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 RAB1AP62820 205 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 NAA40Q86UY6 237 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 AP3S1Q92572 193 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 RAD51DO75771 328 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 LYZL6O75951 148 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 COX5BP10606 129 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 BMXP51813 675 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 MOGQ16653 247 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 COMMD2Q86X83 199 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SP140LQ9H930 580 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 NOX3Q9HBY0 568 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 GPR84Q9NQS5 396 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 TINAGQ9UJW2 476 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 A0A0U1RQV5 110 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 A0A1B0GTI1 187 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 PDCD5O14737 125 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 OR10A3P58181 314 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 PLP2Q04941 152 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 LY6DQ14210 128 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 GABRA6Q16445 453 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 GSG1Q2KHT4 349 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 BEND4Q6ZU67 534 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 OR10A2Q9H208 303 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 A0A0G2JK05 382 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 TBX1O43435 398 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CCL1P22362 96 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ANOS1P23352 680 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 S100A5P33763 92 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 HGFACQ04756 655 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 P2RY6Q15077 328 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CEP78Q5JTW2 689 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 DOK3Q7L591 496 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 BOD1Q96IK1 185 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CKLFQ9UBR5 152 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 NOTOA8MTQ0 251 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 E9PLN8 166 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 IGLV3-1P01715 115 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 LCATP04180 440 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 PMPCAQ10713 525 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 MDP1Q86V88 176 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 C5orf63A6NC05 138 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 LMX1BO60663 402 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 INHBBP09529 407 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ZNF12P17014 697 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 FSTP19883 344 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 STOMP27105 288 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 HOXC12P31275 282 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 OPRM1P35372 400 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 IDNKQ5T6J7 187 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 S100ZQ8WXG8 99 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms