RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TVP23A	A6NH52	213 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C12orf77	C9JDV5	145 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SMLR1	H3BR10	107 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		K7EMT4	169 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		K7EN84	100 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	GABRP	O00591	440 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	AGPAT2	O15120	278 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF253	O75346	499 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	AIFM1	O95831	613 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	GLA	P06280	429 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RSPH10B	P0C881	870 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF224	P0DH78	156 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CT45A6	P0DMU7	189 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CT45A5	P0DMU8	189 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CT45A7	P0DMV0	189 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PGAM2	P15259	253 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	FOLR1	P15328	257 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PGAM1	P18669	254 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	GLP1R	P43220	463 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	KIR2DS4	P43632	304 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CSNK1D	P48730	415 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	VSNL1	P62760	191 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CSNK1G2	P78368	415 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TGFBR3	Q03167	851 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RUNX3	Q13761	415 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	LY6D	Q14210	128 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CLINT1	Q14677	625 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	NRF1	Q16656	503 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C5orf47	Q569G3	176 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	DUPD1	Q68J44	220 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	HORMAD1	Q86X24	394 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	NAXD	Q8IW45	347 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR31	Q8NA23	367 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	APH1B	Q8WW43	257 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ITFG2	Q969R8	447 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C8orf76	Q96K31	380 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINB11	Q96P15	392 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	COPS4	Q9BT78	406 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SCN7A	Q01118	1682 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	BTAF1	O14981	1849 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	NUP98	P52948	1817 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SPEF2	Q9C093	1822 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0G2JLM5	398 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GVI7	797 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SHISA9	B4DS77	424 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CRLF1	O75462	422 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	KBTBD11	O94819	623 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	VENTX	O95231	258 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	GCG	P01275	180 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	GGT1	P19440	569 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB4A	P20338	218 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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