RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 GGT2P36268 569 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 GATA4P43694 442 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MTNR1AP48039 350 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PITPNBP48739 271 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SMIM11AP58511 58 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SPIBQ01892 262 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ECH1Q13011 328 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MAB21L1Q13394 359 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SLC36A3Q495N2 470 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PRR31Q5SQ13 230 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PYURFQ96I23 114 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 OR8B2Q96RD0 313 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ATF6BQ99941 703 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 FN3KQ9H479 309 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 GORASP2Q9H8Y8 452 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 OR10H3O60404 316 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PLATP00750 562 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 HLA-DQA2P01906 255 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SEMG1P04279 462 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 IRF2P14316 349 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 NOS3P29474 1203 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PGAP1Q75T13 922 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CLN8Q9UBY8 286 aa14.12□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MALLQ13021 153 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 FITM2Q8N6M3 262 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 Q8TCH9 128 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MAP6Q96JE9 813 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 IDH3BO43837 385 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 FAM20BO75063 409 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PRDX6P30041 224 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CD200P41217 278 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 GSSP48637 474 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 RAD23AP54725 363 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 TPTEP56180 551 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 IL13RA1P78552 427 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MPPED2Q15777 294 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ERGIC1Q969X5 290 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MGAM2Q2M2H8 2515 aa14.1□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CD300LBA8K4G0 201 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 M0R135 149 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PHYHO14832 338 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 KCNAB3O43448 404 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 FABP3P05413 133 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ZNF823P16415 610 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CA6P23280 308 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 RRM2P31350 389 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PYCR1P32322 319 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 IFNGR2P38484 337 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PSMB10P40306 273 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ZNF799Q96GE5 643 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.09□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 POM121CA8CG34 1229 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 C22orf46C9J442 243 aa14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
HERC3-211ENST00000513325 HSD17B1P14061 328 aa14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms