RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512392.5

CHD1-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene CHD1, Length 1,968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD1-208	ENST00000512392	ST3GAL4	Q11206	333 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM135	Q86UB9	458 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	CLDN23	Q96B33	292 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SORT1	Q99523	831 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	CD84	Q9UIB8	345 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF724	A8MTY0	619 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR11H12	B2RN74	326 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SMKR1	H3BMG3	65 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	RGS14	O43566	566 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SLC16A7	O60669	478 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ZG16	O60844	167 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	NDUFB8	O95169	186 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	NR4A2	P43354	598 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	PDLIM4	P50479	330 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ESRRG	P62508	458 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	FOXF2	Q12947	444 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	PPP1R1A	Q13522	171 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR2F1	Q13607	317 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR11H1	Q8NG94	326 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR11H2	Q8NH07	326 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ARPC1A	Q92747	370 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR51I1	Q9H343	314 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	COPS3	Q9UNS2	423 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	BUB3	O43684	328 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SOX15	O60248	233 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	DCTN3	O75935	186 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ATP6V1B2	P21281	511 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	F8A1	P23610	371 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	CRHR2	Q13324	411 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	FAM53B	Q14153	422 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ZBED5	Q49AG3	693 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TRNP1	Q6NT89	227 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	NIT1	Q86X76	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM219	Q86XT9	240 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SARAF	Q96BY9	339 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TAF1	P21675	1872 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR6C6	A6NF89	314 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	GABRP	O00591	440 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	FOXH1	O75593	365 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	RP2	O75695	350 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	PYCR1	P32322	319 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	TAS2R39	P59534	338 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF154	Q13106	437 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF726P1	Q15940	193 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	WDR82	Q6UXN9	313 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	STX19	Q8N4C7	294 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHD1-208	ENST00000512392	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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