RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF404Q494X3 552 aa16.12■□□□□ 0.17
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SH3BP2-220ENST00000511663 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa16.1■□□□□ 0.17
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SH3BP2-220ENST00000511663 PMELP40967 661 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CD200P41217 278 aa16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM20BO75063 409 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 LIPFP07098 398 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 CA6P23280 308 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 RRM2P31350 389 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 PRSS12P56730 875 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MZT1Q08AG7 82 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPAN31Q12999 210 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 TAF13Q15543 124 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 LYPD2Q6UXB3 125 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATC1Q76KD6 591 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 FITM2Q8N6M3 262 aa16.07■□□□□ 0.16
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