RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510576.6

CLMAT3-201, colorectal liver metastasis associated transcript 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLMAT3, Length 1,973 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZIC3O60481 467 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 VAMP5O95183 116 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SLC2A1P11166 492 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF17P17021 662 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TSPAN5P62079 268 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SGCAQ16586 387 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TEX261Q6UWH6 196 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 FTMTQ8N4E7 242 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 U3KQ87 197 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.66□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TMEM235A6NFC5 223 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CD63P08962 238 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ACP1P24666 158 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TMEM54Q969K7 222 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GPR84Q9NQS5 396 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TECTAO75443 2155 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 M0QYG6 137 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 MASP2O00187 686 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CBR3O75828 277 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SCGNO76038 276 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 STK17BO94768 372 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR2A4O95047 310 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 MSR1P21757 451 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 UNC119Q13432 240 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 POU4F3Q15319 338 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 LPAL2Q16609 132 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 C10orf128Q5T292 105 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 AWAT2Q6E213 333 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 PGAP1Q75T13 922 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GALNT16Q8N428 558 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 AQP3Q92482 292 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR2A7Q96R45 310 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 PIGQQ9BRB3 760 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 KLK13Q9UKR3 277 aa14.65□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 WDPCPO95876 746 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 AMY2AP04746 511 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 ITGB2P05107 769 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 MELTFP08582 738 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 SSTR2P30874 369 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 OTX2P32243 289 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 RAC1P63000 192 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 QRFPP83859 136 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 FAM57BQ71RH2 274 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 DOK3Q7L591 496 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 CHST4Q8NCG5 386 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 CCDC107Q8WV48 283 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 UCN2Q96RP3 112 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 NELFAQ9H3P2 528 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 DMDP11532 3685 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 GJE1A6NN92 205 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 RAB27BO00194 218 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 CD74P04233 296 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 VSIG8P0DPA2 414 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 ABOP16442 354 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 CCL1P22362 96 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 C4orf46Q504U0 113 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 SGCZQ96LD1 299 aa14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLMAT3-201ENST00000510576 POFUT1Q9H488 388 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms