RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 HLA-DPB1P04440 258 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF12P17014 697 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 MDH2P40926 338 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 RAD23AP54725 363 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 PAX2Q02962 417 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 MAB21L1Q13394 359 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 CRMP1Q14194 572 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 SNAI3Q3KNW1 292 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM201AQ5SY85 155 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 USP43Q70EL4 1123 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 LNX2Q8N448 690 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 SPICQ8N5J4 248 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 AQP11Q8NBQ7 271 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 OR52L1Q8NGH7 329 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 OR51L1Q8NGJ5 315 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 OR5L1Q8NGL2 311 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 OR13G1Q8NGZ3 307 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 ST7LQ8TDW4 575 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 ZFAND2BQ8WV99 257 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 MAGIXQ9H6Y5 334 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 C7orf69Q9H7B7 122 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 KCNG2Q9UJ96 466 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-216ENST00000510193 M0R135 149 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 SURF4O15260 269 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 CCNB2O95067 398 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 SOX14O95416 240 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 HLA-DQA2P01906 255 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 GYPBP06028 91 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 WNT2P09544 360 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 CLUP10909 449 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 GATA4P43694 442 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ECH1Q13011 328 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF154Q13106 437 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 PCK2Q16822 640 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF181Q2M3W8 571 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC01590Q5TEZ4 76 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC27A4Q6P1M0 643 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 MOGAT3Q86VF5 341 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 DHFR2Q86XF0 187 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 KLHL36Q8N4N3 616 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF799Q96GE5 643 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 DGCR6LQ9BY27 220 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 C1orf21Q9H246 121 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 MUC13Q9H3R2 512 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM165Q9HC07 324 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 TBC1D23Q9NUY8 699 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 INSIG2Q9Y5U4 225 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 U3KQV3 271 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 GYG2O15488 501 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 LCATP04180 440 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 SRP9P49458 86 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF92Q03936 586 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 MICAQ29983 383 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2T5Q6IEZ7 315 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC00471Q8N535 108 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 TEX29Q8N6K0 151 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF511Q8NB15 262 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 PROKR2Q8NFJ6 384 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2T4Q8NH00 348 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2T29Q8NH02 315 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2AE1Q8NHA4 323 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 NANPQ8TBE9 248 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM246Q9BRR3 403 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 TSSK6Q9BXA6 273 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 HCAR1Q9BXC0 346 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 IFNL4K9M1U5 179 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ACOT8O14734 319 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 FSTL3O95633 263 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 SPI1P17947 270 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 CD200P41217 278 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC25A1P53007 311 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 TPTEP56180 551 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 BNIP1Q12981 228 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 SCGB2A2Q13296 93 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 MPPED2Q15777 294 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF404Q494X3 552 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms