RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 OR51A2Q8NGJ7 313 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 GPR137Q96N19 417 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CLCC1Q96S66 551 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 LDAHQ9H6V9 325 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ANKRD10Q9NXR5 420 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CTSBP07858 339 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ABOP16442 354 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 EIF1P41567 113 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 EPHA4P54764 986 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 RHEBQ15382 184 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FAM209AQ5JX71 171 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 DOK3Q7L591 496 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 OR11G2Q8NGC1 345 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 OPN4Q9UHM6 478 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 OR2J2O76002 312 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 DDAH2O95865 285 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FCARP24071 287 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SKP2Q13309 424 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CEBPEQ15744 281 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ISXQ2M1V0 245 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 RTL6Q6ICC9 239 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 OR1L3Q8NH93 324 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FOXQ1Q9C009 403 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.91□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 OR6C76A6NM76 312 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FOLR3P41439 243 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 CXorf58Q96LI9 332 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 LINC00862A6NCI5 91 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PIN1P1O15428 100 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 IFNA5P01569 189 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SMIM10Q96HG1 83 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 METTL12A8MUP2 240 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FOLR1P15328 257 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 EPHA1P21709 976 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 S100A2P29034 98 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ATP1B3P54709 279 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SLC37A1P57057 533 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF100Q8IYN0 542 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 DNTTIP1Q9H147 329 aa11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SPCS3-201ENST00000503362 BPNT1O95861 308 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SCAND1P57086 179 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PPP1R1AQ13522 171 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 LPAL2Q16609 132 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GAB4Q2WGN9 574 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PHLDA2Q53GA4 152 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 FHL5Q5TD97 284 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GALNT16Q8N428 558 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 NAT6Q93015 286 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SLAMF9Q96A28 289 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZP3P21754 424 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 OMGP23515 440 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CD96P40200 585 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 EFNA3P52797 238 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GPR85P60893 370 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GGTLC2Q14390 218 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PEA15Q15121 130 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PCK2Q16822 640 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF529Q6P280 563 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 AAED1Q7RTV5 226 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 BAP18Q8IXM2 172 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 HGDQ93099 445 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ARL5BQ96KC2 179 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 WBP1LQ9NX94 342 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CD79AP11912 226 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 BEND4Q6ZU67 534 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms