RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 E9PQ18 207 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NPFFO15130 113 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DOK2O60496 412 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PTP4A3O75365 173 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R3DO95685 299 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NUDT7P0C024 238 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ACSM4P0C7M7 580 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 JMJD1CQ15652 2540 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SPRNQ5BIV9 151 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MAVSQ7Z434 540 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MED30Q96HR3 178 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 TOR3AQ9H497 397 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 STARD10Q9Y365 291 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NAT1P18440 290 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SDHAP31040 664 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 GLO1Q04760 184 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 VMACQ2NL98 169 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DRAM2Q6UX65 266 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 TLCD1Q96CP7 247 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CADP27708 2225 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PPH5 198 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 XRCC2O43543 280 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 APOC1P02654 83 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MALLQ13021 153 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 TRAM2Q15035 370 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 STUMQ69YW2 141 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 TAMM41Q96BW9 452 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CENPHQ9H3R5 247 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 VAPAQ9P0L0 249 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CTSZQ9UBR2 303 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MEGF11A6BM72 1044 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFAB1O14561 156 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SCG5P05408 212 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 BLVRAP53004 296 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 AQP5P55064 265 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 GNGT1P63211 74 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RABL3Q5HYI8 236 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CGREF1Q99674 301 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 FUZQ9BT04 418 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SPAG7O75391 227 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 E2F6O75461 281 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 HTR5AP47898 357 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MAB21L1Q13394 359 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 GTDC1Q4AE62 458 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZSR3 168 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 VPS33AQ96AX1 596 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 F2RL2O00254 374 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PATE4P0C8F1 98 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V1B1P15313 513 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 AQP2P41181 271 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CRYBA2P53672 197 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DUSP7Q16829 419 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SPATS1Q496A3 300 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ZBED5Q49AG3 693 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 Q8N7P7 452 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MRAPQ8TCY5 172 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf98E9PRG8 122 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SLC2A10O95528 541 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CST4P01036 141 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 FPR3P25089 353 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 IL5RAQ01344 420 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SGCAQ16586 387 aa6.31□□□□□ -1.4
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