RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 XPNPEP2O43895 674 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC16A7O60669 478 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 IGHV3-9P01782 118 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 PRB1P04280 392 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 YES1P07947 543 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 QDPRP09417 244 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 PSKH1P11801 424 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 CRHBPP24387 322 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 PYCR1P32322 319 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 PTGER4P35408 488 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 CSNK1A1P48729 337 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC25A1P53007 311 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 CDH11P55287 796 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 SIRPAP78324 504 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF91Q05481 1191 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 RBPJQ06330 500 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 APOFQ13790 326 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 IL13RA2Q14627 380 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 GUSBP1Q15486 140 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 HIST3H3Q16695 136 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 LINC01590Q5TEZ4 76 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 TSPO2Q5TGU0 170 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 MEDAGQ5VYS4 303 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 OTPQ5XKR4 325 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 LINGO2Q7L985 606 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 RNF144BQ7Z419 303 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 HDDC2Q7Z4H3 204 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 GID4Q8IVV7 300 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 C20orf196Q8IYI0 205 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 OR6V1Q8N148 313 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 PROKR2Q8NFJ6 384 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 SGCDQ92629 289 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 NSMAFQ92636 917 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 TMEM54Q969K7 222 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 MCHR2Q969V1 340 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 APH1AQ96BI3 265 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 Q96MT0 163 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 DOCK7Q96N67 2140 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 FOXN4Q96NZ1 517 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 TTYH2Q9BSA4 534 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 ALG12Q9BV10 488 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 RACGAP1Q9H0H5 632 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 RERGLQ9H628 205 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 GLRX2Q9NS18 164 aa4.8□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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GAPVD1-218ENST00000495588 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 TVP23AA6NH52 213 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
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GAPVD1-218ENST00000495588 AHCYL1O43865 530 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 TNFSF13O75888 250 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 SEC14L2O76054 403 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 GLCEO94923 617 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 MPZL1O95297 269 aa4.79□□□□□ -1.64
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GAPVD1-218ENST00000495588 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
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GAPVD1-218ENST00000495588 CA7P43166 264 aa4.79□□□□□ -1.64
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GAPVD1-218ENST00000495588 CENPAP49450 140 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 CCR9P51686 369 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 CDH15P55291 814 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 CXCR4P61073 352 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 PMPCAQ10713 525 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 MEP1BQ16820 701 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC35D3Q5M8T2 416 aa4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GAPVD1-218ENST00000495588 THEM4Q5T1C6 240 aa4.79□□□□□ -1.64
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