RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522		D6RAR5	112 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522		L7N2F9	121 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522		M0QYG6	137 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	SULT2B1	O00204	365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	GDF9	O60383	454 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	CD74	P04233	296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	AMY2A	P04746	511 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF28	P17035	718 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	CDA	P32320	146 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	GABRE	P78334	506 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	MFAP5	Q13361	173 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	AQP3	Q92482	292 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	NKD1	Q969G9	470 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	FAM46B	Q96A09	425 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	POFUT1	Q9H488	388 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	OPN4	Q9UHM6	478 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522		A0A1B0GTI1	187 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522		F5H5P2	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	GOSR2	O14653	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	RGS11	O94810	467 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	PMS2P2	O95744	297 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	CELA2A	P08217	269 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	QDPR	P09417	244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	FOSL1	P15407	271 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF20	P17024	532 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	CXCL2	P19875	107 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	H2BFS	P57053	126 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	MPPED2	Q15777	294 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	EXT1	Q16394	746 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	HIST3H3	Q16695	136 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	CLLU1	Q5K131	121 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	OPN5	Q6U736	354 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	CHST6	Q9GZX3	395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	KLK13	Q9UKR3	277 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	RAMP1	O60894	148 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	SIX6	O95475	246 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	UMOD	P07911	640 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF35	P13682	527 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	UNC119	Q13432	240 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	POU4F3	Q15319	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	MR1	Q95460	341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522		C9J4A7	227 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	RAB27B	O00194	218 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	SCGN	O76038	276 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	COX6A1	P12074	109 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	PRKX	P51817	358 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	QRFP	P83859	136 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23	1e-6	■■■■■ 43.4
CALD1-222	ENST00000495522	MEF2D	Q14814	521 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CALD1-222	ENST00000495522	HMSD	A8MTL9	139 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522		H3BUI4	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	OR4E1	P0C645	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	NR2C1	P13056	603 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	RAB14	P61106	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CALD1-222	ENST00000495522	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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