RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-208	ENST00000493601	GATA4	P43694	442 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	MTNR1A	P48039	350 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	PAX2	Q02962	417 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	CLDN34	H7C241	214 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	FABP3	P05413	133 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	HSD17B1	P14061	328 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	PITPNB	P48739	271 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	PGAP1	Q75T13	922 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601		Q8TCH9	128 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	UPRT	Q96BW1	309 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	FN3K	Q9H479	309 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	OR6C68	A6NDL8	312 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	PHYH	O14832	338 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	LCAT	P04180	440 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	GGT2	P36268	569 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	CD200	P41217	278 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	GSS	P48637	474 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	TPTE	P56180	551 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	PRSS12	P56730	875 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	CLN8	Q9UBY8	286 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601		M0R135	149 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	ARPC2	O15144	300 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	TMPRSS2	O15393	492 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	PLAT	P00750	562 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF823	P16415	610 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	RRM2	P31350	389 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	PMEL	P40967	661 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	RAD23A	P54725	363 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	IL13RA1	P78552	427 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	TSPAN31	Q12999	210 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF799	Q96GE5	643 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM20B	O75063	409 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	OR8G1	Q15617	311 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	KCNJ8	Q15842	424 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	MAP6	Q96JE9	813 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	KRT36	O76013	467 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	NPY4R	P50391	375 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRU-208	ENST00000493601	NAA40	Q86UY6	237 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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