RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 GPR148Q8TDV2 347 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM234Q8WY98 164 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ARGFXA6NJG6 315 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR6C76A6NM76 312 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ADAM10O14672 748 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR2T1O43869 369 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DHFRP00374 187 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 IGF2P01344 180 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CDK2P24941 298 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MMP15P51511 669 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF519Q8TB69 540 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 C4orf45Q96LM5 186 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ABHD6Q9BV23 337 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PNR3 127 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZFAND5O76080 213 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF28P17035 718 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SFTPDP35247 375 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLC17A1Q14916 467 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LRRC46Q96FV0 321 aa6.24□□□□□ -1.41
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HERC4-211ENST00000492996 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR8B4Q96RC9 309 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SPSB2Q99619 263 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM212A6NML5 194 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 G3V3Y1 287 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MS4A18H0YCH9 400 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TGM6O95932 706 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NR2C1P13056 603 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF823P16415 610 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LCN1P31025 176 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OPRM1P35372 400 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ART1P52961 327 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 GLO1Q04760 184 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HFEQ30201 348 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 GPR137Q96N19 417 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EFNA2O43921 213 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CD1AP06126 327 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CCL4P13236 92 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CXCL3P19876 107 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DNASE1P24855 282 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DCTDP32321 178 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EFNB2P52799 333 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 BIDP55957 195 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EGR3Q06889 387 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SMCO1Q147U7 214 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CARD17Q5XLA6 110 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.23□□□□□ -1.41
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