RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 RAXQ9Y2V3 346 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 C5orf51A6NDU8 294 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 GPX5O75715 221 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 AMY2AP04746 511 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 SOX18P35713 384 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 SPERTQ8NA61 448 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 APH1BQ8WW43 257 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 RAB3CQ96E17 227 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 APC2O95996 2303 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PNV4 684 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 A6NIN4 97 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 GPANK1O95872 356 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 CHRM2P08172 466 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 CDONQ4KMG0 1287 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 HACD4Q5VWC8 232 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 C4orf45Q96LM5 186 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A7Q99884 636 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 MYLKQ15746 1914 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM127O75204 238 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 MPZL1O95297 269 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 RAB3DO95716 219 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 RAC2P15153 192 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 VEGFCP49767 419 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF69Q9UC07 566 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 CALCBP10092 127 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 THBS4P35443 961 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 FABP5Q01469 135 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 RTP5Q14D33 572 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 P2RY6Q15077 328 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 HAVCR1Q96D42 359 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SYT3Q9BQG1 590 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 HPNP05981 417 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 FXYD6P3P58550 94 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 PMPCAQ10713 525 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 MEF2DQ14814 521 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 FADS6Q8N9I5 356 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 HPS1Q92902 700 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 TIMD4Q96H15 378 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF221Q9UK13 617 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PR80 420 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 H7C1Q1 480 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 PLPP2O43688 288 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 GALP22466 123 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 NR4A2P43354 598 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 CRYBA2P53672 197 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 OR8B8Q15620 311 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 PCK2Q16822 640 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 WDR38Q5JTN6 314 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZTK2 550 aa7.33□□□□□ -1.24
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