RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-208ENST00000485792 M0R233 179 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 DLGAP1O14490 977 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 PRODHO43272 600 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 DOK2O60496 412 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 TIPRLO75663 272 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 HPXP02790 462 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 GYPBP06028 91 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ACSM4P0C7M7 580 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 RAC2P15153 192 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 SELEP16581 610 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 PYCR1P32322 319 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 APLNRP35414 380 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 LIPAP38571 399 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 CRYBB2P43320 205 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ALDH3B1P43353 468 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 NR4A2P43354 598 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 RGS6P49758 472 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 GDI2P50395 445 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 BLVRAP53004 296 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 CRISP1P54107 249 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 RIPPLY3P57055 190 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 TMEM33P57088 247 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 PPP1CBP62140 327 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 GALK2Q01415 458 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 TRIP10Q15642 601 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 FAM209AQ5JX71 171 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 SPATA46Q5T0L3 261 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 C12orf73Q69YU5 71 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 VHLLQ6RSH7 139 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 NAA40Q86UY6 237 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 SPATA24Q86W54 205 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 OR52L1Q8NGH7 329 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 OR51L1Q8NGJ5 315 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 OR2T4Q8NH00 348 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 SLC25A40Q8TBP6 338 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 RNF133Q8WVZ7 376 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 FAM168AQ92567 244 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 SPSB4Q96A44 273 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 COG8Q96MW5 612 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 SYT3Q9BQG1 590 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 OR2J1Q9GZK6 312 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 TPK1Q9H3S4 243 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 RNF121Q9H920 327 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 WDR76Q9H967 626 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 CDH20Q9HBT6 801 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 HAO2Q9NYQ3 351 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 PRR13Q9NZ81 148 aa4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 TVP23AA6NH52 213 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 IQCF6A8MYZ5 107 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 CD5LO43866 347 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 GLCEO94923 617 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 IGLV3-1P01715 115 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 IGHV1-46P01743 117 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 HMGN1P05114 100 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ALPLP05186 524 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 FCGR1AP12314 374 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 DAOP14920 347 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ZNF23P17027 643 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ACHEP22303 614 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 COL8A2P25067 703 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 FASP25445 335 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 FMO3P31513 532 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 OPRL1P41146 370 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 MAGEB1P43366 347 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 HTR5AP47898 357 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ENTPD1P49961 510 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 PDLIM4P50479 330 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 NUDT6P53370 316 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 LMO4P61968 165 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 GGTLC2Q14390 218 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 GINS1Q14691 196 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 MOGQ16653 247 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 KLHL12Q53G59 568 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 SLC35D3Q5M8T2 416 aa4.84□□□□□ -1.63
CUX1-208ENST00000485792 SLC25A30Q5SVS4 291 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms