RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 AP4M1O00189 453 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 MT-ND4LP03901 98 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 GNB3P16520 340 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 GNALP38405 381 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 PPA1Q15181 289 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 FHL5Q5TD97 284 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 EDAQ92838 391 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.13□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 STARD5Q9NSY2 213 aa7.13□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 EML2O95834 649 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 HLA-DQA2P01906 255 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 HTR2CP28335 458 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 MAP3K8P41279 467 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 NPY4RP50391 375 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CCR4P51679 360 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 RAB2AP61019 212 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ALG11Q2TAA5 492 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 MRI1Q9BV20 369 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 ACTBL2Q562R1 376 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 TMEM225Q6GV28 225 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 SSX9Q7RTT3 188 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CDC20BQ86Y33 519 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 OR4C3Q8NH37 302 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ST7LQ8TDW4 575 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 COL4A6Q14031 1691 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ZNF727A8MUV8 499 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CTSVO60911 334 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 RDH16O75452 317 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 BPNT1O95861 308 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 MELTFP08582 738 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 CASP6P55212 293 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 C1orf61Q13536 156 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 FAM166AQ6J272 317 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 S100PBPQ96BU1 408 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.12□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TREM2Q9NZC2 230 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ACACAQ13085 2346 aa7.12□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 OR10H2O60403 315 aa7.11□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 SLC34A2O95436 690 aa7.11□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 IL2RAP01589 272 aa7.11□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 HOXB5P09067 269 aa7.11□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 OR13C7P0DN81 318 aa7.11□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ITGA3P26006 1051 aa7.11□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 SULT1A1P50225 295 aa7.11□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 GAMTQ14353 236 aa7.11□□□□□ -1.27
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