RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465282.5

USP39-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-211ENST00000465282 HAVCR1Q96D42 359 aa14.53□□□□□ -0.08
USP39-211ENST00000465282 SYT3Q9BQG1 590 aa14.53□□□□□ -0.08
USP39-211ENST00000465282 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.53□□□□□ -0.08
USP39-211ENST00000465282 OPA3Q9H6K4 179 aa14.53□□□□□ -0.08
USP39-211ENST00000465282 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.53□□□□□ -0.08
USP39-211ENST00000465282 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP39-211ENST00000465282 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.53□□□□□ -0.08
USP39-211ENST00000465282 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP39-211ENST00000465282 A0A1W2PPW3 197 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 KITLGP21583 273 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 CDKN1AP38936 164 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 HSPA13P48723 471 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 CX3CR1P49238 355 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ART1P52961 327 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 HCCSP53701 268 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ATP5J2P56134 94 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 CXCR4P61073 352 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 KLHL22Q53GT1 634 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 SHEQ5VZ18 495 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 SPATC1Q76KD6 591 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 NAA40Q86UY6 237 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 LRP11Q86VZ4 500 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 SNX33Q8WV41 574 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 RNFT2Q96EX2 444 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 OR8B4Q96RC9 309 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 FZR1Q9UM11 496 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 OTOGQ6ZRI0 2925 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 CREBBPQ92793 2442 aa14.52□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PLSCR5A0PG75 271 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 IRGMA1A4Y4 181 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 J3QRE1 110 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 XRCC2O43543 280 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 SULT1C4O75897 302 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 CLPTM1O96005 669 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 SELEP16581 610 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 RAB40BQ12829 278 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PSG7Q13046 419 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 APH1BQ8WW43 257 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ITFG2Q969R8 447 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 CMBLQ96DG6 245 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 COPS3Q9UNS2 423 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 LRP12Q9Y561 859 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 CLIC3O95833 236 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 MPV17P39210 176 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 EFNA4P52798 201 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 AQP4P55087 323 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ZNF91Q05481 1191 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 USP51Q70EK9 711 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PERPQ96FX8 193 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 RGCCQ9H4X1 137 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 AKAP9Q99996 3911 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 KRT8P05787 483 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ADRA2AP08913 450 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 VHLP40337 213 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 MMP15P51511 669 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 MMP16P51512 607 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 TESK1Q15569 626 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 FAM209AQ5JX71 171 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-211ENST00000465282 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms