RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR2T27	Q8NH04	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	NSMAF	Q92636	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MUCL1	Q96DR8	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	C1orf198	Q9H425	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ARID1A	O14497	2285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RER1	O15258	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SGCE	O43556	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TMCC2	O75069	709 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF254	O75437	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SULT1C4	O75897	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ABHD16A	O95870	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PTH	P01270	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ADRA2A	P08913	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF32	P17041	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TUBG1	P23258	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CRHBP	P24387	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CD40	P25942	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DCK	P27707	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CDH11	P55287	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC35A2	P78381	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	IRF3	Q14653	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RAB35	Q15286	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MEP1B	Q16820	701 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731		Q6ZSR3	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MDP1	Q86V88	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	GGH	Q92820	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	AMELY	Q99218	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	COQ7	Q99807	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms