RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCN6P62502 163 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAAAQ02083 359 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FMODQ06828 376 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD47Q08722 323 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB35Q15286 201 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADIPOQQ15848 244 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF74Q16587 644 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSG1Q2KHT4 349 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM91A1Q658Y4 838 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA21Q7Z572 469 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 VTCN1Q7Z7D3 282 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLDN22Q8N7P3 220 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYT14Q8NB59 555 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5J2Q8NH18 312 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM255BQ8WV15 326 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 C10orf82Q8WW14 230 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PROX1Q92786 737 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTULINQ96BN8 352 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TXNDC15Q96J42 360 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMTM3Q96MX0 182 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUS81Q96NY9 551 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OXGR1Q96P68 337 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPYCQ99645 322 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3GL3Q99963 347 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECSITQ9BQ95 431 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 KATNB1Q9BVA0 655 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 REG4Q9BYZ8 158 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAR1AQ9NR31 198 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NANSQ9NR45 359 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CA10Q9NS85 328 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHCGQ9UBD6 479 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAB1Q9NY15 2570 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A096LNT2 108 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PPW3 197 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRP5LA4QPB2 252 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF726A6NNF4 738 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 BBIP1A8MTZ0 92 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYNX1G3V0Z9 82 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 H7C417 338 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 M0QX08 132 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NME4O00746 187 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLPP3O14495 311 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPA12AO43301 675 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2T1O43869 369 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 VAMP5O95183 116 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYPD3O95274 346 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC2A10O95528 541 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV3-15P01624 115 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYNX1P0DP58 116 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL2P13500 99 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAX1P15863 534 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCK1P16333 377 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 AQP2P41181 271 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALDH3B1P43353 468 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GZMMP51124 257 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC7A2P52569 658 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERVS71-1P61550 626 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALK2Q01415 458 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBBP4Q09028 425 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRF3Q14653 427 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPRE2Q15555 327 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCCQ4KMZ1 466 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf52Q5T4I8 152 aa3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTPQ5XKR4 325 aa3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms