RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 C1orf226A1L170 272 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 C7orf66A4D0T2 115 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FABP12A6NFH5 140 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SNTNA6NMZ2 147 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 MCIDASD6RGH6 385 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 ORC5O43913 435 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 ZIC3O60481 467 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 TSPAN2O60636 221 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 UGDHO60701 494 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 NDUFS7O75251 213 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 CBR3O75828 277 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 DIRAS1O95057 198 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 NUDT3O95989 172 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 PLAUP00749 431 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 PSKH1P11801 424 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 POU2F1P14859 743 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 DDX5P17844 614 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 CFL1P23528 166 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 IL32P24001 234 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 TACR3P29371 465 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SRD5A2P31213 254 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SDC2P34741 201 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 CD79BP40259 229 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 EMDP50402 254 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 NUDT6P53370 316 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 MAPK12P53778 367 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 CRISP1P54107 249 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 GAS1P54826 345 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 CLDN15P56746 228 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 HMGCS1Q01581 520 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SPHARQ15513 63 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 MED22Q15528 200 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 TATDN3Q17R31 274 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 IFI44LQ53G44 452 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 CLLU1Q5K131 121 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 PDZK1Q5T2W1 519 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 DDI2Q5TDH0 399 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM205BPQ63HN1 556 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 C12orf73Q69YU5 71 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC48A1Q6P1K1 146 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM131AQ6UXB0 335 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 NPSR1Q6W5P4 371 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC30A8Q8IWU4 369 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 OR4M2Q8NGB6 313 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM163Q8TC26 289 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 ENKURQ8TC29 256 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 AP3S1Q92572 193 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 CREB3L1Q96BA8 519 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 RADILQ96JH8 1075 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SFXN2Q96NB2 322 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 MND1Q9BWT6 205 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 PIGUQ9H490 435 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FOLH1BQ9HBA9 442 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 ABCB9Q9NP78 766 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 TIGARQ9NQ88 270 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 IMPAD1Q9NX62 359 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FLRT3Q9NZU0 649 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 DKKL1Q9UK85 242 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SNX8Q9Y5X2 465 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FKBP7Q9Y680 259 aa4.83□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 PLCE1Q9P212 2302 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 IRGMA1A4Y4 181 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FRG2CA6NGY1 282 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC22A20A6NK97 555 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM157AC9JC47 383 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 TO15178 435 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 RGS5O15539 181 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 LYRM1O43325 122 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 AKR7A2O43488 359 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 REM1O75628 298 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SNAPC5O75971 98 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 OR7A10O76100 309 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 ADAP00813 363 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 PDYNP01213 254 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 CGAP01215 116 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 IGHV4-39P01824 125 aa4.82□□□□□ -1.64
NANOGP4-201ENST00000427230 SLPIP03973 132 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms