RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0B4J203 849 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0J9YW62 118 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 KRT33AO76009 404 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OPN1LWP04000 364 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 MSR1P21757 451 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ENPP1P22413 925 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 HSD11B1P28845 292 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 MAGEB1P43366 347 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF84P51523 738 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RRADP55042 308 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PER3P56645 1201 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CARD18P57730 90 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TAF13Q15543 124 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TATDN3Q17R31 274 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LINGO2Q7L985 606 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 KRT74Q7RTS7 529 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 GJC3Q8NFK1 279 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PHF21AQ96BD5 680 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR2M2Q96R28 347 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 NELFAQ9H3P2 528 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 EMC3Q9P0I2 261 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.86□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1B0GVI7 797 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SULT1C2O00338 296 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 DHHO43323 396 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SYT7O43581 403 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LANCL1O43813 399 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SCGNO76038 276 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 HTR2CP28335 458 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 GDNFP39905 211 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PTH2RP49190 550 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H3AP68431 136 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 DGCR2P98153 550 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FAM189A2Q15884 450 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 DCAF10Q5QP82 559 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PGAP1Q75T13 922 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LUZP2Q86TE4 346 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SIAH3Q8IW03 269 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM123Q8N131 208 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 Q8NA96 180 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SLC7A6Q92536 515 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RELTQ969Z4 430 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 MARVELD3Q96A59 401 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ORAI1Q96D31 301 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SFXN2Q96NB2 322 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LRFN1Q9P244 771 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.85□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 NF1P21359 2839 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1B0GVC2 190 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 A6NIN4 97 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TNFSF11O14788 317 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RAMP1O60894 148 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CEACAM4O75871 244 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TTRP02766 147 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TCRBP04435 133 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 HPNP05981 417 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CD3GP09693 182 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ACSM4P0C7M7 580 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms